Лаборатория „Мехатроника“ е създадена през 2003 година и има факултетен статут. Първият й ръководител от МФ е проф. д-р Тодор Нешков. Екипът на лабораторията има дългогодишен опит в областта на приложението на мехатронния подход при:

• проектиране  конструиране на мехатронни системи и други
• автоматизацията на дискретното производство;
• автоматизираните системи за управление;
• роботика;
• използване на CAD/CAM/CAE и CIM системите;

През годините членовете на лабораторията са работили по множество национални и международни изследователски и образователни проекти. Резултатите от тези проекти са намерили приложение в индустрията и висшето образование.

Екипът на лабораторията включва трима доктори и шест дипломирани магистри с висока квалификация в решаването на инженерни проблеми. Четирима от екипа са редовни докторанти, работещи по тематика свързана със съвременните инженерни подходи и CAD/CAM/CAE технологии.          

Лабораторията е основател и активен член на Националния клъстер “Мехатроника и автоматизация”, обединяващ 21 предприятия и институти у нас.